Winnie Karnofka studierte Angewandte Theaterwissenschaft an der Justus-Liebig-Universität in Gießen. Es folgte der Aufbaustudiengang »Interkulturelle Japan-Kompetenz für Hochschulabsolventen« an der Eberhard-Karls-Universität Tübingen und der Dōshisha Universität Kyōto. Ihr erstes Engagement führte sie 2007 als Dramaturgin an das Deutsche Nationaltheater Weimar. 2009 arbeitete sie als Regisseurin am Musiktheater im Revier Gelsenkirchen. Seit der Spielzeit 2010/2011 ist Winnie Karnofka als Dramaturgin am DT in Göttingen tätig.
Winnie Karnofka wirkt mit bei "KUNST", CABARET, DAS LEBEN DER FISCHE (UA), DER THEATERMACHER, DER ZAUBERBERG, EINLAUF DER ALLIGATOREN!, GUT GEGEN NORDWIND, JEDERMANN , WAHRLICH, ICH SAGE EUCH... und WEST SIDE STORY.